Митно-податкова адміністрація має право здійснювати контроль товарів, що перебувають в обігу між країнами і територіями, що не входять до митної зони Європейського Союзу. Контрольні заходи включають в себе перевірку товарів, контроль транспортних засобів і багажу пасажирів та можуть здійснюватися по всій території країни. Права посадових осіб, які представляють митні органи під час проведення перевірок, у тому числі обшуку транспортних засобів, визначені Законом про Національну податкову адміністрацію («Законодавчий вісник» за 2016 р. поз. 1947).
Перевірка транспортних засобів здійснюється з урахуванням ризику виникнення порушень або за принципом випадковості. Перевірки за принципом випадковості проводяться за вказівкою інформаційної системи або за вибором відповідного транспорту для контролю службовцем митного органу. Службовець не повинен вказувати причини, з яких він здійснює обшук. Проведення обшуку даного транспортного засобу відбувається виключно на його розсуд.(ст. 58 закону про НПА) Перевірки на автомобільних дорогах загального користування або внутрішніх трасах виконує офіцер у службовій формі, на підставі службового посвідчення, а також постійного дозволу на здійснення контролю. Службове посвідчення та постійний дозвіл пред’являються на запит особи, яку перевіряють.
Контроль на прикордонних переходах, у відділах митно-податкових органів або у визначених для цього місцях, здійснює офіцер у службовій формі, на якій містяться ознаки ідентифікації особистості. Він не повинен мати постійний дозвіл на здійснення контролю. (ст. 62 закону про НПА)
Особа, яку перевіряють, зобов’язана надавати в необхідному обсязі технічні засоби (у тому числі вилкові навантажувачі), якщо вони необхідні для проведення митно-податкового контролю. (ст. 72 абз. 1 п. 8 закону про НПА)
Особа, яка перевозить товари, що підлягають митно-податковому контролю зобов’язана, за власний рахунок, виконати всі дії, які дозволяють здійснити перевірку, зокрема, розвантажити, показати і завантажити товар після закінчення проведення контрольних заходів. (ст. 67 абз. 2. закону про НПА)
У разі здійснення контролю на автомобільних дорогах загального користування або на прикордонних переходах, у відділах митно-податкових органів або призначених для цього місцях, службовець складає Акт перевірки лише у випадку виявлення порушень.
Якщо в ході перевірки не було виявлено порушень, Акт складається тільки на вимогу особи, яку перевіряють. (ст. 81 закону про НПА)